Το Κυπριακό, ήταν ανάμεσα σε πολλά άλλα, το θέμα που απασχόλησε τις δύο πλευρές καθώς είναι από τα εμπόδια που υπάρχουν στην συνεργασία των δύο οργανισμών. Τόσο γιατί παρατηρείται το παράδοξο, ένα μέλος του ΝΑΤΟ και υποψήφιο για ένταξη στην Ευρωπαϊκή Ένωση κράτος όπως η Τουρκία να μην αναγνωρίζει κράτος-μέλος της Ένωσης, όπως η Κυπριακή Δημοκρατία, όσο και η συμπεριφορά της Τουρκίας στο Αιγαίο με τις προκλήσεις και τις παραβιάσεις του εναέριου χώρου, για τις οποίες βέβαια είναι ήδη ενήμερος ο Γενικός Γραμματέας από την Μόνιμη Ελληνική Αντιπροσωπεία στις Βρυξέλλες.
«Η επιθυμία της Ελλάδας είναι τα προβλήματα αυτά να λυθούν και να αρθεί το αδιέξοδο που δημιουργεί το άλλο παράδοξο στην συνεργασία των δύο οργανισμών. Η στρατιωτική αποστολή του ΝΑΤΟ και η πολιτική αποστολή της Ε.Ε. να βρίσκονται πλάι-πλάι στο Αφγανιστάν και να μη συνεργάζονται και το ίδιο να γίνεται και στα ανοιχτά της Σομαλίας και να μη μπορούν να συνεργαστούν για την αντιμετώπιση της πειρατείας» τόνισε ο εκπρόσωπος του Υπουργείου Εξωτερικών Γρηγόρης Δελαβέκουρας ενημερώνοντας για την επίσκεψη του κ. Ράσμουσεν.
Μετά την ανταλλαγή απόψεων με την ελληνική πλευρά ο Γενικός Γραμματέας του ΝΑΤΟ θα επισκεφθεί αύριο την Τουρκία όπου σύμφωνα με πληροφορίες θα ζητήσει από την ηγεσία της να διευρύνει την εντολή των στρατευμάτων της στο Αφγανιστάν, ώστε τουρκικά στρατεύματα να βρεθούν στην πρώτη γραμμή των μαχών. Αυτό τουλάχιστον άφησε να εννοηθεί ο κ. Ράσμουσεν σε συνέντευξή του στην εφημερίδα «Μιλιέτ».
Σήμερα αναμένονται οι ανακοινώσεις του Υπουργείου Εξωτερικών μετά τις συνομιλίες των δύο πλευρών.